El departamento de Amazonas posee una flora realmente exuberante y muy variada, usada con fines alimenticios, medicinales, maderables, de construcción, teñidos, etc.
Al sur del departamento, las vertientes del valle del Marañón presentan escasa vegetación. En las grandes alturas andinas destacan las gramíneas. Al norte de la provincia de Utcubamba hay algunos bosques de algarrobo, cactus, crotos y matorrales.
Bosque de Algarrobos
Crotos
En la región selvática, en especial al norte del departamento, en las provincias de Bagua y Condorcanqui, y al sureste, en la provincia de Rodríguez de Mendoza, crece una vegetación tropical con árboles maderables (caoba, cedro, tornillo, maruá, palo violeta, ishpingo), plantas medicinales (uña de gato), frutales, palmeras y helechos gigantes. Entre las variedades de palmeras existen algunas comestibles como la que produce el delicioso palmito.
Caoba
Cedro
Ishpingo
Uña de Gato
No menos variada que la flora es la fauna del departamento. Entre esta diversidad destaca el mono choro de cola amarilla, especie única en el mundo y actualmente en peligro de extinción. Este mamífero estuvo considerado, por más de medio siglo, como extinguido; pero en 1974 fue redescubierto por la expedición de Damacedo y Luscomba a las provincias de Bongará y Bagua.
Mono Choro Cola Amarilla
Otros mamíferos de la selva alta de Amazonas, en particular de los bosques tropicales, son los venados rojos, osos hormigueros, sachavacas, sajinos, osos de anteojo, tigrillos, jaguares, pumas, monos fraile, monos coto y otros. Entre las aves destacan el gallito de las rocas (ave nacional), el tucán, el colibrí, diversidad de aves de rapiña y el loro carpintero. Entre los roedores, el añuje y maja. El añuje o agutí (Dasyprocta paraguayensis) es un roedor mediano de color pardo rojizo, muy vivaz y escurridizo; vive en los huecos de los troncos de árboles caídos o en agujeros excavados en el suelo, se desplaza a saltos y para comer se apoya en sus patas traseras.
Sachavaca
Añuje
La selva de Amazonas también se encuentra poblada por bellas mariposas y una diversidad de ofidios, entre los que se encuentran la cascabel y la shushupe (Lachesis muta); esta última es una víbora muy venenosa, que llega a medir más de dos metros de largo.
Shushupe
En esta región también se puede encontrar algunos peces de agua dulce. Destaca la gamitana, que alcanza hasta 80 cm de longitud; la doncella, bagre de grandes dimensiones (llega a superar los dos metros) y sin escamas, pero de carne muy sabrosa; y el bocachico, pez abundante en ríos y lagunas.
Bocachico
Gamitana
En la región serrana habita una multitud de aves, como el majestuoso cóndor andino, gallinazos, tortolitas, palomas y perdices sudamericanas (Nothoprocta pentlandii custaleti). Entre los mamíferos destaca el zorro de los Andes (de mayor tamaño que el de la costa), el puma y en especial el venado gris (Cdocoileus peruvianus). Este último vive en la alta montaña, hasta los 4 500 metros sobre el nivel del mar, destacándose en su fisonomía los cuernos ramificados de los ejemplares machos.
Cóndor Andino
La vizcacha (Lagidium peruvianum), roedor típico del Perú, de larga cola y color gris, habita también en las alturas andinas.
Vizcacha
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